전령 rna의 3′말단 서열 분석 방법

[기술 요약] 기존 mRNA 3'말단 서열 분석 방법은 핵산 반복서열인 폴리(A) 서열 분석에 어려움이 있었고, 소량의 시료로는 많은 유전자 정보를 얻기 어려웠습니다. 본 기술은 이러한 한계를 극복하기 위해 mRNA 3'말단에 3'헤어핀 어댑터를 연결하고 부분적으로 절단한 후 5'어댑터를 연결하여 시퀀싱하는 'mTAIL-seq' 프로토콜을 제안합니다. 이 방법은 바이오틴이 결합된 3'헤어핀 어댑터를 사용하여 폴리(A)+ RNA를 특이적으로 캡쳐하고, RNase T1으로 mRNA를 부분 절단한 뒤 스트렙타비딘 비드로 분리 및 정제하는 과정을 거칩니다. 이후 증폭 및 일루미나 시퀀싱 방식을 적용하여 정규화된 T 시그널 분석을 통해 폴리(A) 서열의 시퀀싱 오류를 극복하고 길이를 정밀하게 결정합니다. 이를 통해 소량의 시료에서도 많은 유전자의 mRNA 3'말단 서열 정보를 효율적이고 신속하게 분석할 수 있으며, 시간과 비용을 크게 절감할 수 있습니다. 특히 배아발생, 암, 신경전달 등 다양한 생명현상에서 RNA 생성/소멸 및 단백질 생산 연구에 필수적인 도구로 활용될 것으로 기대됩니다.

기술 분야

전령 RNA 서열 분석

기관

기초과학연구원

등록번호

1017863960000

키워드

생명 현상 연구, 고감도 분석, RNA 시퀀싱, 생체 시료 분석, 폴리A 꼬리, 유전자 분석, 바이오인포매틱스, 분자생물학 기술, 핵산 분석, mRNA 3말단 서열 분석, 유전체 조절, 비용 절감 시퀀싱, 전령 RNA, mTAIL-seq, 단백질 생산, 생체분석, 유전공학, 제약기술, 바이오산업, 첨단 바이오